MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12 plasmid unnamed

Total Repeats: 592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016825	CAT	2	6	41	46	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016825	GCA	2	6	66	71	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016825	CGC	2	6	91	96	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_016825	TAAA	2	8	100	107	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016825	ACC	2	6	161	166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_016825	TGA	2	6	196	201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016825	A	6	6	243	248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016825	CTG	2	6	260	265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016825	ATTT	2	8	552	559	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016825	T	7	7	612	618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016825	GTT	2	6	648	653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016825	CT	4	8	661	668	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_016825	T	6	6	668	673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016825	TAAA	2	8	724	731	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016825	ACC	2	6	749	754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_016825	TCA	2	6	4120	4125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016825	AGC	2	6	4141	4146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016825	TA	3	6	5740	5745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016825	GTT	2	6	6657	6662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016825	CGAAAC	2	12	7034	7045	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016825	AAG	2	6	7048	7053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016825	TG	3	6	7087	7092	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016825	AAG	2	6	7132	7137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016825	GAA	2	6	7185	7190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016825	AGTAC	2	10	7224	7233	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_016825	A	9	9	7300	7308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016825	CTT	2	6	7326	7331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016825	AT	3	6	7352	7357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016825	ATT	2	6	8347	8352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016825	GTGG	2	8	8387	8394	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016825	TAC	2	6	8407	8412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016825	A	6	6	8496	8501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016825	GAA	2	6	9462	9467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016825	TCC	2	6	10462	10467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_016825	GAA	2	6	10474	10479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016825	ATA	2	6	10504	10509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016825	TAAA	2	8	11462	11469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016825	A	6	6	11467	11472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016825	GTA	2	6	12454	12459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016825	TAAA	2	8	13216	13223	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016825	C	8	8	13238	13245	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42	NC_016825	CAA	2	6	14616	14621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016825	CGT	2	6	14888	14893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016825	TAA	2	6	18195	18200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016825	CCGC	2	8	19591	19598	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_016825	GGT	2	6	20657	20662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016825	TC	3	6	21052	21057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016825	TA	4	8	21993	22000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016825	AAG	2	6	22003	22008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016825	TCAT	2	8	22049	22056	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_016825	AGTT	2	8	22136	22143	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016825	TAC	2	6	22340	22345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016825	TAAA	2	8	22361	22368	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016825	ATG	2	6	24252	24257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016825	CCT	2	6	24302	24307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_016825	T	6	6	25036	25041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016825	GTT	2	6	25052	25057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016825	AAT	2	6	25078	25083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016825	ATTC	2	8	25099	25106	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_016825	TC	3	6	32432	32437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016825	T	7	7	37008	37014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016825	A	6	6	37041	37046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016825	A	8	8	37072	37079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016825	T	6	6	37106	37111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016825	TCAG	2	8	38552	38559	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_016825	TAT	2	6	38564	38569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016825	AAT	2	6	38570	38575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016825	GTA	2	6	38628	38633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016825	A	7	7	38663	38669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016825	T	6	6	38697	38702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016825	ATA	2	6	38710	38715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016825	TTA	2	6	38730	38735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016825	TACA	2	8	38794	38801	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_016825	CAAA	2	8	38807	38814	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_016825	ACC	2	6	38835	38840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_016825	T	7	7	38841	38847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016825	CAA	2	6	38863	38868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016825	TTC	2	6	38949	38954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016825	TAA	2	6	39033	39038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016825	A	8	8	39045	39052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016825	TTA	2	6	39074	39079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016825	TTTA	2	8	40876	40883	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016825	CAC	2	6	40887	40892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_016825	A	6	6	40972	40977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016825	A	6	6	41174	41179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016825	TGA	2	6	41181	41186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016825	GTA	2	6	41197	41202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016825	CAT	2	6	43976	43981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016825	T	6	6	44000	44005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016825	TAAA	2	8	44043	44050	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016825	AAT	2	6	44061	44066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016825	ATG	2	6	44081	44086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016825	T	6	6	44093	44098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016825	TA	3	6	46401	46406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016825	TAT	2	6	46468	46473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016825	TTCTT	2	10	46491	46500	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_016825	ATT	2	6	46519	46524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016825	CAA	2	6	46574	46579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016825	G	6	6	46627	46632	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016825	GAA	2	6	46672	46677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016825	TTC	2	6	46716	46721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016825	ACG	2	6	48729	48734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016825	CCA	2	6	48751	48756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_016825	GATTA	2	10	48775	48784	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016825	A	7	7	48832	48838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016825	TGT	2	6	48858	48863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016825	A	6	6	48883	48888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016825	CAAT	2	8	48896	48903	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_016825	AG	3	6	48934	48939	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016825	T	6	6	48940	48945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016825	ACT	2	6	49168	49173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016825	CTTTTA	2	12	49217	49228	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_016825	AAT	2	6	49437	49442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016825	C	6	6	49496	49501	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
115	NC_016825	TTA	2	6	49643	49648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016825	T	6	6	49674	49679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016825	GTT	2	6	49681	49686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016825	TAA	2	6	49705	49710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016825	CGCAT	2	10	49717	49726	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_016825	CAT	2	6	49771	49776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016825	ATTT	2	8	49792	49799	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016825	A	6	6	49814	49819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016825	TA	3	6	49833	49838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016825	TTAT	2	8	49843	49850	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016825	ATG	2	6	49864	49869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016825	TTGG	2	8	49901	49908	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016825	ATA	2	6	49925	49930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016825	CTGAT	2	10	49932	49941	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_016825	AAT	2	6	49971	49976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016825	TCA	2	6	49990	49995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_016825	ATTC	2	8	49997	50004	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016825	TGC	2	6	50018	50023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016825	ATG	2	6	50043	50048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016825	CCT	2	6	50093	50098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_016825	GTG	2	6	50116	50121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016825	CCG	2	6	50138	50143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_016825	ATAA	2	8	52081	52088	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016825	GCC	2	6	52091	52096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_016825	AGA	2	6	54972	54977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016825	TAT	2	6	55052	55057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016825	GGCA	2	8	55068	55075	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_016825	AAC	2	6	55085	55090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_016825	CAAAA	2	10	55124	55133	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_016825	ATT	2	6	60180	60185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016825	AG	3	6	64336	64341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016825	ATTGTT	2	12	64358	64369	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016825	ATA	2	6	64773	64778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016825	TTTC	2	8	64788	64795	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_016825	ACC	2	6	64808	64813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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151	NC_016825	T	7	7	64841	64847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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343	NC_016825	T	7	7	106575	106581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_016825	AATGTA	2	12	130146	130157	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_016825	AT	3	6	131597	131602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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473	NC_016825	CAA	2	6	146490	146495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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500	NC_016825	A	7	7	153039	153045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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